Sanne Nieuwenhuijsen begon haar muzikale opleiding als jonge koorzanger aan de Kathedrale Koorschool Utrecht. Aan het Koninklijk Conservatorium in Den Haag studeerde ze hoofdvak koordirectie en solozang. Ze nam deel aan masterclasses koordirectie bij onder meer Tonu Kaljuste, het Nederlands Kamerkoor, Veljo Tormis en Kaspar Putnins, en het Stuttgarter Kammerchor met Frieder Bernius. Haar specialisatie ligt bij de Engelse koorcultuur met stages bij St. John’s College Cambridge en Westminster Abbey en samenwerkingen met diverse topkoren uit de UK.
Onder meer het Kathedrale Koor St. Bavo, kamerkoor Vocoza uit Amsterdam en het Rotterdamse Erasmus kamerkoor stonden onder haar leiding. Deelnames aan (inter)nationale koorfestivals leverden regelmatig prijzen op met deze ensembles.
Tot 2023 bekleedde Sanne de functie van Magistra Cantus aan het Muziekinstituut van de Kathedraal Sint Bavo te Haarlem en was ze dirigent bij de daaraan verbonden Koorschool Haarlem. Momenteel werkt Sanne bij Vocaal Talent Nederland (Nationale Koren) en dirigeert zij participatiekoren: koren voor zangers met haperend brein en ‘mantelzangers’.